मैग्नीशियम के कई फायदे हैं, लेकिन इस पूरक का सेवन जोखिम से खाली नहीं है, खासकर जब अधिक मात्रा में लिया जाता है या कुछ स्वास्थ्य स्थितियों वाले व्यक्तियों द्वारा लिया जाता है।
गैस्ट्रोइंटेस्टाइनल गड़बड़ी-दस्त, मतली, पेट में ऐंठन-सबसे आम दुष्प्रभाव है, मुख्य रूप से ऐसे रूपों के साथ जो खराब अवशोषित होते हैं, जैसे ऑक्साइड और सल्फेट।
मैग्नीशियम की उच्च खुराक में गंभीर हाइपोटेंशन, मांसपेशियों में कमजोरी, भ्रम और अनियमित दिल की धड़कन शामिल हैं; अत्यधिक मामलों में विषाक्तता संभव है। गुर्दे से संबंधित विकारों से पीड़ित या कम कुशल गुर्दे वाले व्यक्तियों में जोखिम होने की एक अनोखी संभावना होती है क्योंकि उनका सिस्टम मैग्नीशियम की अधिकता को कुशलता से साफ़ नहीं कर पाता है।
मूत्रवर्धक, एंटीबायोटिक्स और हृदय संबंधी दवाओं सहित दवाओं के साथ परस्पर क्रिया या तो दुष्प्रभाव बढ़ा सकती है या प्रभावकारिता में खलल डाल सकती है। पूरक लेने से पहले अपने डॉक्टर से जांच करना बहुत अच्छा विचार है।